牙周炎患者的口腔犹如一个细菌的蓄水池，尤其是牙床下，更是装满数以万计的细菌，由致病菌和非致病菌组成。在身体健康的情况下，这些细菌同时存在，一旦打破这种平衡状态，则可导致口腔内组织的感染。值得注意的是，这些细菌并非永远都在口腔内活动，它们也会随着血液循环而进入身体其它部位进而引起感染发炎。

近年来，大量的临床研究证明，牙周炎患者患糖尿病的概率是正常人的7倍，且牙周炎和糖尿病有双向关系，糖尿病也是牙周病的危险因素之一。流行病学调查发现，牙周炎患者的冠心病发病率高于正常人群20%。50岁以下男性牙周炎患者或无牙者冠心病发病率高出普通人群70%。

牙周炎同时还可能引起消化性溃疡、胃癌、胰腺癌；作为感染病灶，还可引起全身多部位风湿性或类风湿性疾病，如关节炎、肾小球肾炎、虹膜睫状体炎及某些皮肤病。对于某些特殊人群如孕妇，牙周炎有可能造成早产儿、低体重儿和流产。