2013年12月香港大学新发传染病国家重点实验室的 Kwok-Yung Yuen 教授在Journal of InfeCTion杂志首次证明了霉酚酸具有针对新型 MERS-CoV的体外抗病毒活性，同时提示干扰素 -β1b 和霉酚酸应考虑作为中东呼吸系统综合征（MERS）的试验性治疗，但是目前仍没有疫苗可以预防MERS。

在47例患者中，有42例（89%）在重症监护室治疗，34例（72%）接受机械通气。平均机械通气时间为7天，平均死亡时间为14天。大多数病人接受奥司他韦和覆盖常见社区获得性肺炎病原菌的抗菌药物治疗。其中有5例患者经验性接受氟康唑治疗，2例应用激素，5例应用利巴韦林，1例应用干扰素-α以及5例应用免疫球蛋白。

目前尚无可用的疫苗或特异性治疗方法。治疗方法是支持性的和基于病人的临床状况应当采取适当措施，减少将病毒从感染病人传给其他病人、医务人员和探访者的危险。应当针对医务人员开展感染防控技能教育和培训并定期更新知识。